RAVON participeert in enkele samenwerkingsverbanden op het gebied van natuuronderzoek en –bescherming. 

• RAVON is lid van de Stichting VeldOnderzoek Flora en Fauna (VOFF) die onderzoeksactiviteiten door vrijwilligers op het gebied van planten en dieren coördineert.
  De VOFF entameert gezamenlijke projecten. Enkele voorbeelden zijn het realiseren van cursussen voor het werven van nieuwe vrijwilligers, inbreng bij de Inhaalslag Verspreidingsonderzoek en projecten op het gebied van laagdrempelige invoermodules voor waarnemingen en verbeteringen in de databases van de PGO’s (EcoGrid-project).

• RAVON participeert in het Platform Soortbeschermende Organisaties (PSO) dat soortgerichte beschermingsactiviteiten op landelijk niveau behartigt.
  In 2005 heeft het PSO onder andere hard getrokken aan het tot stand komen van het nieuwe meerjarenprogramma soortenbeleid. Daarnaast is het PSO betrokken bij een aantal gedragscodes in het kader van ontheffingen van Flora en Fauna Wet.

• RAVON maakt ook deel uit van het NCN (Nederlands Centrum voor Natuuronderzoek), een consortium van de Radboud Universiteit Nijmegen, Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica, afdeling Dieroecologie, afdeling Oecologie, afdeling Milieukunde, Stichting Bargerveen, SOVON Vogelonderzoek Nederland, VOFF en RAVON.
  In NCN-verband is ondermeer het rapport ‘Visstandsbeheerplan stadswateren Nijmegen’ opgesteld, zijn colleges gegeven en zijn studenten geworven om in Nijmegen hun stage te lopen.

• De RAVON Werkgroep Monitoring werkt samen met de Universiteit van Amsterdam. Zo worden er bijvoorbeeld regelmatig colleges gegeven en studenten begeleid.

• RAVON participeert in het Vissennetwerk. Het Vissennetwerk is een netwerk van personen die informatie, kennis en ideeën uitwisselen, zowel vanuit een wetenschappelijke als praktische invalshoek, gericht op vissen, visserij en de leefomgeving van vissen. RAVON neemt actief deel aan het netwerk. Dit jaar is er gewerkt aan de thema’s soort- en gebiedbescherming, vismigratie, benutting van visstanden en de bescherming van de paling. 
   
• Het Natuurloket is een onafhankelijke informatiemakelaar, die gegevens over beschermde soorten toegankelijk maakt. Deze gegevens zijn afkomstig uit de databanken van Particuliere Gegevensbeherende Organisaties (PGO's), verenigd in de Vereniging Onderzoek Flora en Fauna (VOFF). Het Natuurloket bezit zelf geen gegevens.
   
• Waarneming.nl en RAVON zijn tot samenwerking overgegaan. De via waarneming.nl ingevoerde gegevens van reptielen, amfibieën en vissen worden aan RAVON ter beschikking gesteld. RAVON zet de waarnemingen in voor onderzoek en bescherming van (kwetsbare) soorten.

• Gegevensautoriteit Natuur (GaN): RAVON werkt samen met de GaN. Een van de belangrijkste activiteiten van de GaN is de inrichting en het beheer van de Nationale Databank Flora en Fauna (NDFF)