RAVON voert op het gebied van reptielen, amfibieen en vissen onderzoek uit op verschillende niveaus. Dit kan gaan om een inventarisatie van een bepaald gebied voor het opstellen van beleid en beheer, maar ook om een telemetrisch onderzoek naar het leefgebied en dispersie van een soort of een onderzoek naar het landhabitat van bijvoorbeeld de knoflookpad.

Enkele voorbeelden van onderzoeksprojecten die RAVON uitvoert of in de planning heeft zijn:

• Batrachochytrium dendrobatidis schimmel - Onderzoek naar de schimmelziekte chytridiomycose die in het buitenland reeds voor grote sterfte onder amfibieën heeft gezorgd.  
• Effect kunstlicht op amfibieën - Wat voor effect heeft kunstmatige straatverlichting op de aanwezige amfibieën? 
• Faunapassages - Hoe functioneren faunapassages (amfibieëntunnels), aan welke eisen moeten deze voldoen en hoe moeten bestaande faunapassages onderhouden worden.
• Methodologisch onderzoek poldervissen  Onderzoek naar de benodigde vangstinspanning met verschillende vangtuigen (schepnet, elektrisch vissen en fuiken) voor een aantal poldervissen.
• Telemetrisch onderzoek naar de rugstreeppad   Onderzoek naar het habitatgebruik, homerange en dispersievermogen van de rugstreeppad in de Noordoostpolder.