Monitoring van populaties is van groot belang om uitspraken te kunnen doen over de status van de Nederlandse reptielen, amfibieën en vissen. Hiervoor is het nodig om op een gestandaardiseerde manier gegevens te verzamelen over een tijdreeks.

Reptielen en amfibieën:
RAVON heeft twee landelijke meetnetten waar honderden vrijwilligers aan meewerken. De Werkgroep Monitoring is verantwoordelijk voor de organisatie deze meetnetten. De beide meetnetten opereren landelijk binnen het Netwerk Ecologische Monitoring, het NEM, een organisatie waarbij ook andere flora en fauna meetnetten zijn aangesloten. De meetnetten van het NEM worden financieel gesteund door het Ministerie van Landbouw, Natuur en Voedselkwaliteit en het Centraal Bureau voor de Statistiek.
 

Vissen:
In opdracht van de Waterdienst van Rijkswaterstaat voeren RAVON en Bureau Natuurbalans - Limes Divergens de actieve vismonitoring in de grote rivieren uit. De bemonsteringen worden uitgevoerd met behulp van onderzoeksvaartuigen van het ministerie van LNV waarbij "actief" wordt gevist met de vangtuigen kor en het elektrovis-apparaat.

RAVON werkt momenteel aan het opzetten van een meetnet voor zoetwatervissen (in opdracht van het Ministerie van Landbouw, Natuur en Voedselkwaliteit).